Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB9P17482 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms