Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EPCAMP16422 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms