Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDGFRAP16234 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDGFRAP16234 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDGFRAP16234 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDGFRAP16234 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDGFRAP16234 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRAP16234 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRAP16234 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRAP16234 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRAP16234 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRAP16234 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRAP16234 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRAP16234 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRAP16234 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRAP16234 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRAP16234 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRAP16234 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRAP16234 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRAP16234 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRAP16234 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRAP16234 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDGFRAP16234 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms