Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRG2P13727 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRG2P13727 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRG2P13727 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRG2P13727 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRG2P13727 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRG2P13727 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRG2P13727 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRG2P13727 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRG2P13727 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRG2P13727 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRG2P13727 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRG2P13727 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRG2P13727 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRG2P13727 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRG2P13727 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRG2P13727 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRG2P13727 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRG2P13727 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRG2P13727 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRG2P13727 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PRG2P13727 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRG2P13727 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRG2P13727 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRG2P13727 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRG2P13727 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRG2P13727 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRG2P13727 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRG2P13727 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRG2P13727 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PRG2P13727 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRG2P13727 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRG2P13727 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRG2P13727 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRG2P13727 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRG2P13727 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRG2P13727 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRG2P13727 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRG2P13727 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRG2P13727 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRG2P13727 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRG2P13727 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRG2P13727 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRG2P13727 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRG2P13727 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRG2P13727 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRG2P13727 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRG2P13727 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRG2P13727 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRG2P13727 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRG2P13727 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRG2P13727 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRG2P13727 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRG2P13727 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRG2P13727 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRG2P13727 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRG2P13727 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRG2P13727 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms