Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HKR1P10072 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HKR1P10072 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HKR1P10072 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HKR1P10072 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HKR1P10072 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HKR1P10072 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HKR1P10072 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HKR1P10072 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HKR1P10072 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HKR1P10072 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HKR1P10072 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HKR1P10072 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HKR1P10072 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HKR1P10072 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HKR1P10072 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HKR1P10072 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HKR1P10072 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HKR1P10072 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HKR1P10072 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HKR1P10072 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HKR1P10072 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms