Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC166P0CW27 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC166P0CW27 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms