Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CT47B1P0C2W7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CT47B1P0C2W7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CT47B1P0C2W7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CT47B1P0C2W7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CT47B1P0C2W7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms