Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN3P07498 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSN3P07498 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CSN3P07498 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSN3P07498 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CSN3P07498 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSN3P07498 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSN3P07498 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSN3P07498 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSN3P07498 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CSN3P07498 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSN3P07498 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CSN3P07498 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CSN3P07498 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CSN3P07498 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CSN3P07498 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CSN3P07498 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CSN3P07498 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CSN3P07498 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSN3P07498 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CSN3P07498 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CSN3P07498 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSN3P07498 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSN3P07498 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSN3P07498 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSN3P07498 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSN3P07498 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSN3P07498 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSN3P07498 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSN3P07498 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSN3P07498 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSN3P07498 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSN3P07498 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSN3P07498 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSN3P07498 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSN3P07498 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSN3P07498 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSN3P07498 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSN3P07498 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSN3P07498 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSN3P07498 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSN3P07498 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSN3P07498 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSN3P07498 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSN3P07498 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSN3P07498 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSN3P07498 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSN3P07498 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSN3P07498 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSN3P07498 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CSN3P07498 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSN3P07498 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSN3P07498 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSN3P07498 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSN3P07498 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSN3P07498 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSN3P07498 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSN3P07498 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CSN3P07498 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSN3P07498 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSN3P07498 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSN3P07498 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSN3P07498 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CSN3P07498 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSN3P07498 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSN3P07498 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSN3P07498 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSN3P07498 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSN3P07498 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSN3P07498 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSN3P07498 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSN3P07498 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSN3P07498 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSN3P07498 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSN3P07498 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSN3P07498 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSN3P07498 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSN3P07498 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSN3P07498 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSN3P07498 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSN3P07498 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CSN3P07498 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSN3P07498 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSN3P07498 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CSN3P07498 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CSN3P07498 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CSN3P07498 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CSN3P07498 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSN3P07498 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CSN3P07498 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms