Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSF1RP07333 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSF1RP07333 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSF1RP07333 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSF1RP07333 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSF1RP07333 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSF1RP07333 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSF1RP07333 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSF1RP07333 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSF1RP07333 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSF1RP07333 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSF1RP07333 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSF1RP07333 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSF1RP07333 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CSF1RP07333 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSF1RP07333 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSF1RP07333 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSF1RP07333 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSF1RP07333 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms