Protein–RNA interactions for Protein: P04233

CD74, HLA class II histocompatibility antigen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD74P04233 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD74P04233 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD74P04233 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD74P04233 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD74P04233 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD74P04233 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD74P04233 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD74P04233 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD74P04233 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD74P04233 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD74P04233 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD74P04233 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD74P04233 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD74P04233 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD74P04233 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD74P04233 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD74P04233 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD74P04233 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD74P04233 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD74P04233 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD74P04233 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD74P04233 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD74P04233 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD74P04233 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD74P04233 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD74P04233 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD74P04233 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD74P04233 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD74P04233 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD74P04233 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD74P04233 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD74P04233 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD74P04233 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD74P04233 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD74P04233 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD74P04233 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD74P04233 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD74P04233 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD74P04233 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD74P04233 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD74P04233 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD74P04233 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD74P04233 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD74P04233 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD74P04233 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD74P04233 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD74P04233 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD74P04233 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD74P04233 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD74P04233 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD74P04233 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD74P04233 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD74P04233 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD74P04233 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD74P04233 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD74P04233 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD74P04233 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD74P04233 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD74P04233 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD74P04233 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD74P04233 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD74P04233 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD74P04233 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD74P04233 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD74P04233 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD74P04233 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD74P04233 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD74P04233 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD74P04233 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD74P04233 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD74P04233 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD74P04233 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD74P04233 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD74P04233 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD74P04233 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD74P04233 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD74P04233 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD74P04233 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD74P04233 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD74P04233 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD74P04233 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD74P04233 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD74P04233 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD74P04233 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD74P04233 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD74P04233 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD74P04233 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD74P04233 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD74P04233 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD74P04233 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD74P04233 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD74P04233 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD74P04233 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD74P04233 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD74P04233 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD74P04233 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD74P04233 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD74P04233 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD74P04233 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD74P04233 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms