Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC3P02656 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC3P02656 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC3P02656 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC3P02656 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC3P02656 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC3P02656 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC3P02656 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC3P02656 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC3P02656 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC3P02656 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC3P02656 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC3P02656 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC3P02656 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC3P02656 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC3P02656 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC3P02656 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC3P02656 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC3P02656 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC3P02656 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC3P02656 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC3P02656 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC3P02656 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC3P02656 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC3P02656 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC3P02656 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC3P02656 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC3P02656 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC3P02656 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC3P02656 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC3P02656 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC3P02656 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC3P02656 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC3P02656 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC3P02656 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC3P02656 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC3P02656 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC3P02656 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC3P02656 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC3P02656 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC3P02656 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC3P02656 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC3P02656 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC3P02656 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC3P02656 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC3P02656 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC3P02656 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC3P02656 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC3P02656 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC3P02656 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC3P02656 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC3P02656 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC3P02656 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC3P02656 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC3P02656 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC3P02656 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC3P02656 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC3P02656 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC3P02656 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC3P02656 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC3P02656 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC3P02656 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC3P02656 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC3P02656 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC3P02656 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC3P02656 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC3P02656 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC3P02656 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC3P02656 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC3P02656 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC3P02656 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC3P02656 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC3P02656 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC3P02656 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC3P02656 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC3P02656 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC3P02656 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC3P02656 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC3P02656 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC3P02656 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC3P02656 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC3P02656 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC3P02656 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC3P02656 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC3P02656 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC3P02656 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC3P02656 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC3P02656 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC3P02656 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC3P02656 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC3P02656 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC3P02656 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC3P02656 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC3P02656 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC3P02656 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC3P02656 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC3P02656 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC3P02656 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC3P02656 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC3P02656 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms