Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX4O95219 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX4O95219 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX4O95219 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX4O95219 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX4O95219 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX4O95219 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX4O95219 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX4O95219 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX4O95219 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX4O95219 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX4O95219 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX4O95219 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX4O95219 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX4O95219 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX4O95219 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX4O95219 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX4O95219 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX4O95219 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX4O95219 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX4O95219 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX4O95219 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX4O95219 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX4O95219 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX4O95219 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX4O95219 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX4O95219 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX4O95219 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX4O95219 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX4O95219 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX4O95219 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX4O95219 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX4O95219 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX4O95219 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX4O95219 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX4O95219 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX4O95219 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX4O95219 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX4O95219 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX4O95219 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX4O95219 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX4O95219 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX4O95219 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX4O95219 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX4O95219 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX4O95219 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNX4O95219 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SNX4O95219 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SNX4O95219 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SNX4O95219 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX4O95219 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX4O95219 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX4O95219 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX4O95219 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX4O95219 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX4O95219 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX4O95219 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms