Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F6O75461 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F6O75461 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F6O75461 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F6O75461 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F6O75461 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F6O75461 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F6O75461 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F6O75461 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F6O75461 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F6O75461 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F6O75461 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F6O75461 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F6O75461 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F6O75461 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F6O75461 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F6O75461 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F6O75461 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F6O75461 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F6O75461 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F6O75461 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F6O75461 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F6O75461 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F6O75461 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F6O75461 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F6O75461 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F6O75461 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F6O75461 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F6O75461 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F6O75461 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F6O75461 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F6O75461 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F6O75461 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F6O75461 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F6O75461 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F6O75461 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F6O75461 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F6O75461 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F6O75461 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F6O75461 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F6O75461 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F6O75461 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F6O75461 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F6O75461 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F6O75461 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E2F6O75461 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F6O75461 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F6O75461 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F6O75461 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F6O75461 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F6O75461 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F6O75461 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F6O75461 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F6O75461 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F6O75461 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F6O75461 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F6O75461 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E2F6O75461 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms