Protein–RNA interactions for Protein: O75128

COBL, Protein cordon-bleu, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLO75128 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLO75128 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLO75128 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLO75128 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLO75128 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLO75128 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLO75128 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLO75128 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLO75128 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLO75128 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLO75128 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLO75128 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLO75128 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLO75128 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLO75128 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLO75128 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLO75128 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLO75128 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLO75128 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLO75128 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLO75128 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLO75128 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLO75128 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLO75128 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLO75128 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLO75128 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLO75128 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COBLO75128 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COBLO75128 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COBLO75128 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COBLO75128 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COBLO75128 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COBLO75128 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COBLO75128 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COBLO75128 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COBLO75128 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COBLO75128 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COBLO75128 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COBLO75128 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COBLO75128 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COBLO75128 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COBLO75128 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COBLO75128 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COBLO75128 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COBLO75128 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLO75128 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLO75128 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLO75128 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLO75128 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLO75128 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLO75128 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLO75128 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLO75128 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLO75128 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLO75128 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLO75128 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLO75128 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLO75128 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLO75128 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLO75128 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLO75128 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLO75128 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLO75128 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLO75128 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLO75128 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLO75128 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLO75128 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLO75128 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLO75128 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLO75128 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLO75128 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLO75128 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLO75128 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLO75128 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLO75128 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLO75128 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLO75128 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLO75128 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLO75128 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLO75128 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLO75128 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLO75128 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLO75128 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLO75128 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLO75128 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLO75128 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLO75128 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLO75128 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLO75128 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLO75128 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLO75128 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLO75128 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLO75128 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLO75128 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLO75128 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLO75128 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLO75128 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COBLO75128 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COBLO75128 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COBLO75128 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms