Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CALUO43852 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CALUO43852 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CALUO43852 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CALUO43852 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CALUO43852 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CALUO43852 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CALUO43852 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CALUO43852 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CALUO43852 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CALUO43852 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CALUO43852 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CALUO43852 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALUO43852 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALUO43852 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALUO43852 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALUO43852 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CALUO43852 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALUO43852 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALUO43852 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALUO43852 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALUO43852 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALUO43852 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALUO43852 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CALUO43852 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALUO43852 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALUO43852 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALUO43852 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALUO43852 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CALUO43852 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALUO43852 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALUO43852 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALUO43852 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALUO43852 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALUO43852 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALUO43852 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALUO43852 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALUO43852 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALUO43852 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALUO43852 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALUO43852 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALUO43852 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALUO43852 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALUO43852 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALUO43852 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CALUO43852 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALUO43852 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALUO43852 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALUO43852 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALUO43852 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALUO43852 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALUO43852 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALUO43852 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALUO43852 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CALUO43852 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CALUO43852 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CALUO43852 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CALUO43852 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CALUO43852 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CALUO43852 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CALUO43852 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CALUO43852 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CALUO43852 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CALUO43852 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CALUO43852 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CALUO43852 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALUO43852 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CALUO43852 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALUO43852 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALUO43852 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALUO43852 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALUO43852 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CALUO43852 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CALUO43852 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALUO43852 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALUO43852 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALUO43852 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALUO43852 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALUO43852 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALUO43852 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALUO43852 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALUO43852 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALUO43852 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALUO43852 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALUO43852 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALUO43852 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CALUO43852 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALUO43852 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALUO43852 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALUO43852 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALUO43852 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALUO43852 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALUO43852 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALUO43852 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALUO43852 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALUO43852 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALUO43852 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALUO43852 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALUO43852 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CALUO43852 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms