Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms