Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms