Protein–RNA interactions for Protein: O00499

BIN1, Myc box-dependent-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN1O00499 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BIN1O00499 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BIN1O00499 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BIN1O00499 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BIN1O00499 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BIN1O00499 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BIN1O00499 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BIN1O00499 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BIN1O00499 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BIN1O00499 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BIN1O00499 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BIN1O00499 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BIN1O00499 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BIN1O00499 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BIN1O00499 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BIN1O00499 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BIN1O00499 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BIN1O00499 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BIN1O00499 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BIN1O00499 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BIN1O00499 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BIN1O00499 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BIN1O00499 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BIN1O00499 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BIN1O00499 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BIN1O00499 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BIN1O00499 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BIN1O00499 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BIN1O00499 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BIN1O00499 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BIN1O00499 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BIN1O00499 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BIN1O00499 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BIN1O00499 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BIN1O00499 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BIN1O00499 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BIN1O00499 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BIN1O00499 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BIN1O00499 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BIN1O00499 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BIN1O00499 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BIN1O00499 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BIN1O00499 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BIN1O00499 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BIN1O00499 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BIN1O00499 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BIN1O00499 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BIN1O00499 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BIN1O00499 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BIN1O00499 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BIN1O00499 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BIN1O00499 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BIN1O00499 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BIN1O00499 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BIN1O00499 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BIN1O00499 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BIN1O00499 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BIN1O00499 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BIN1O00499 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BIN1O00499 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BIN1O00499 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BIN1O00499 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BIN1O00499 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BIN1O00499 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BIN1O00499 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BIN1O00499 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BIN1O00499 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BIN1O00499 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BIN1O00499 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BIN1O00499 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BIN1O00499 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BIN1O00499 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BIN1O00499 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BIN1O00499 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BIN1O00499 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BIN1O00499 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BIN1O00499 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BIN1O00499 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BIN1O00499 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BIN1O00499 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BIN1O00499 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BIN1O00499 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BIN1O00499 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BIN1O00499 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BIN1O00499 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BIN1O00499 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BIN1O00499 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BIN1O00499 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BIN1O00499 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BIN1O00499 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BIN1O00499 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BIN1O00499 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BIN1O00499 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BIN1O00499 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BIN1O00499 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BIN1O00499 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BIN1O00499 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BIN1O00499 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BIN1O00499 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BIN1O00499 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms