Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms