Protein–RNA interactions for Protein: J3QW42

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QW42 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QW42 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QW42 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QW42 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QW42 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QW42 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QW42 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QW42 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QW42 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QW42 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QW42 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QW42 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QW42 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QW42 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QW42 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QW42 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QW42 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QW42 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QW42 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QW42 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QW42 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QW42 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QW42 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QW42 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QW42 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QW42 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QW42 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QW42 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QW42 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QW42 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QW42 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QW42 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QW42 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QW42 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QW42 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QW42 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QW42 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QW42 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QW42 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QW42 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QW42 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QW42 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QW42 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QW42 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QW42 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QW42 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QW42 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QW42 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QW42 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QW42 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QW42 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QW42 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QW42 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QW42 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QW42 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QW42 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QW42 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QW42 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QW42 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QW42 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QW42 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QW42 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QW42 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QW42 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QW42 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QW42 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QW42 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QW42 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QW42 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QW42 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QW42 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QW42 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QW42 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QW42 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QW42 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QW42 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QW42 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QW42 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QW42 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QW42 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QW42 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QW42 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QW42 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QW42 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QW42 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QW42 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QW42 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QW42 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QW42 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QW42 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QW42 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QW42 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QW42 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QW42 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QW42 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QW42 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QW42 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QW42 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QW42 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QW42 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms