Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01387J3KSC0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms