Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CROCC2H7BZ55 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms