Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms