Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BNH8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BNH8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BNH8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BNH8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BNH8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BNH8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BNH8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BNH8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BNH8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BNH8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BNH8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BNH8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BNH8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BNH8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BNH8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BNH8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BNH8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BNH8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BNH8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BNH8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BNH8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BNH8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BNH8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BNH8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BNH8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BNH8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BNH8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BNH8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BNH8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BNH8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BNH8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BNH8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BNH8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BNH8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BNH8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BNH8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BNH8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BNH8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BNH8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BNH8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BNH8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BNH8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BNH8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BNH8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BNH8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BNH8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BNH8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BNH8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BNH8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BNH8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BNH8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BNH8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BNH8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BNH8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BNH8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BNH8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BNH8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BNH8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BNH8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BNH8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BNH8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BNH8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BNH8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BNH8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BNH8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BNH8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BNH8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BNH8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BNH8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BNH8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BNH8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BNH8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BNH8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BNH8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BNH8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BNH8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BNH8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BNH8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BNH8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H3BNH8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H3BNH8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H3BNH8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H3BNH8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H3BNH8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms