Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCRIP1C9JLW8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms