Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

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Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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