Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A8MVJ9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A8MVJ9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A8MVJ9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A8MVJ9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A8MVJ9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A8MVJ9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A8MVJ9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A8MVJ9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A8MVJ9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A8MVJ9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A8MVJ9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A8MVJ9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
A8MVJ9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A8MVJ9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
A8MVJ9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A8MVJ9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A8MVJ9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
A8MVJ9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A8MVJ9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A8MVJ9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A8MVJ9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A8MVJ9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A8MVJ9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A8MVJ9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A8MVJ9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A8MVJ9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A8MVJ9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A8MVJ9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A8MVJ9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A8MVJ9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A8MVJ9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A8MVJ9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A8MVJ9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A8MVJ9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
A8MVJ9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A8MVJ9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A8MVJ9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A8MVJ9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A8MVJ9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A8MVJ9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A8MVJ9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A8MVJ9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A8MVJ9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A8MVJ9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A8MVJ9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A8MVJ9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A8MVJ9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A8MVJ9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A8MVJ9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A8MVJ9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
A8MVJ9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
A8MVJ9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
A8MVJ9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
A8MVJ9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
A8MVJ9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
A8MVJ9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
A8MVJ9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
A8MVJ9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
A8MVJ9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A8MVJ9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A8MVJ9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A8MVJ9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
A8MVJ9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A8MVJ9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A8MVJ9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A8MVJ9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
A8MVJ9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A8MVJ9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A8MVJ9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A8MVJ9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A8MVJ9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A8MVJ9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A8MVJ9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A8MVJ9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A8MVJ9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A8MVJ9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A8MVJ9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A8MVJ9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A8MVJ9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A8MVJ9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A8MVJ9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A8MVJ9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A8MVJ9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A8MVJ9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A8MVJ9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A8MVJ9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A8MVJ9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A8MVJ9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A8MVJ9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
A8MVJ9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A8MVJ9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A8MVJ9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A8MVJ9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A8MVJ9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A8MVJ9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
A8MVJ9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A8MVJ9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A8MVJ9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A8MVJ9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms