Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms