Protein–RNA interactions for Protein: A8MTJ6

FOXI3, Forkhead box protein I3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI3A8MTJ6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXI3A8MTJ6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXI3A8MTJ6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXI3A8MTJ6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXI3A8MTJ6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXI3A8MTJ6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXI3A8MTJ6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXI3A8MTJ6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXI3A8MTJ6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXI3A8MTJ6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXI3A8MTJ6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXI3A8MTJ6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXI3A8MTJ6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXI3A8MTJ6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXI3A8MTJ6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXI3A8MTJ6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXI3A8MTJ6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXI3A8MTJ6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXI3A8MTJ6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXI3A8MTJ6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXI3A8MTJ6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXI3A8MTJ6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXI3A8MTJ6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXI3A8MTJ6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXI3A8MTJ6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXI3A8MTJ6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXI3A8MTJ6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FOXI3A8MTJ6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
FOXI3A8MTJ6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXI3A8MTJ6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms