Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms