Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCNX2A6NKB5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms