Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC69A6NI79 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms