Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CFAP73A6NFT4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms