Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZNF316A6NFI3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms