Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms