Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 SPTLC3-201ENST00000399002 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 FRY-207ENST00000542859 13200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 GON4L-219ENST00000622608 4801 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 BDNF-206ENST00000395983 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 XIRP2-206ENST00000409728 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 RAB5B-210ENST00000553116 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 STK32B-204ENST00000510398 3241 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 MYLK4-201ENST00000274643 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 YES1-201ENST00000314574 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 PTPRB-208ENST00000550358 6583 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 PIWIL2-204ENST00000521356 3488 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 ERG-205ENST00000398910 4954 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 HNRNPK-201ENST00000351839 2652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 SCYL2-211ENST00000635101 3948 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 RN7SL36P-201ENST00000469345 276 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 IGKV1D-16-201ENST00000492446 378 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 AC100823.2-201ENST00000518337 699 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 AC010605.1-201ENST00000597303 797 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 LINC01002-204ENST00000631644 473 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 PDLIM5-222ENST00000615540 6219 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 ABI1-209ENST00000376166 3441 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 ZKSCAN8-202ENST00000457389 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 FRMD6-202ENST00000356218 4768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 AL591379.1-201ENST00000315293 3739 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 EYA1-202ENST00000340726 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 COPB2-201ENST00000333188 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 PPP2R1B-206ENST00000527614 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 IQCA1-206ENST00000431676 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 TTC6-203ENST00000476979 2253 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 ZNF512-203ENST00000413371 3703 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 NOL4-201ENST00000261592 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 PRND-201ENST00000305817 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 RNU4-81P-201ENST00000363561 144 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 SNORA10-201ENST00000384084 133 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 FREM2-AS1-201ENST00000448887 465 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 SNRPD2P1-201ENST00000489253 354 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 CHCHD2P7-201ENST00000508008 452 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 AL020996.2-202ENST00000527604 334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 TRBV10-3-201ENST00000611462 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 AP2B1-221ENST00000621914 5702 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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