Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRRC2-202ENST00000395905 5100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 DPF3-216ENST00000614862 4221 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF662-204ENST00000440367 4099 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 MRPL19-202ENST00000393909 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 C9orf72-206ENST00000619707 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLG-202ENST00000308192 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 TTL-201ENST00000233336 14269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 NYAP2-201ENST00000272907 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC139495.3-201ENST00000515156 4437 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLUHP3-206ENST00000562354 4117 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007938.4-201ENST00000610046 4118 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 EFHC1-233ENST00000637353 3829 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02068-201ENST00000418839 3212 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 WRAP53-201ENST00000316024 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTF2-214ENST00000545708 4046 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 BSN-201ENST00000296452 15955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 FTSJ3-201ENST00000427159 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 FIGNL1-214ENST00000617389 3259 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 PDE6A-201ENST00000255266 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLP1-220ENST00000612423 3132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP5G3-201ENST00000284727 5484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP002490.1-201ENST00000502284 4233 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLOCK-202ENST00000381322 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 RHBDD1-202ENST00000392062 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC6A15-201ENST00000266682 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADCY10P1-202ENST00000457653 3785 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC138951.1-201ENST00000502532 2685 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRO-208ENST00000420798 3613 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 HNRNPA3-202ENST00000411529 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 EXO1-202ENST00000366548 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 LILRA2-201ENST00000251376 4429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 BCAS1-202ENST00000395961 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 LCN1-201ENST00000263598 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC009237.9-201ENST00000414800 347 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP001062.2-201ENST00000426029 127 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPP1R14D-202ENST00000427255 747 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 SDHCP3-201ENST00000445371 506 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL316P-201ENST00000483452 272 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL700P-201ENST00000496982 294 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00967-202ENST00000517725 259 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC090115.1-201ENST00000548257 562 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC138907.5-201ENST00000561744 273 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR4266-201ENST00000583300 55 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP001017.1-201ENST00000591378 482 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC119751.8-201ENST00000597032 156 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL451054.3-201ENST00000611115 776 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 Metazoa_SRP.175-201ENST00000619837 250 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 Metazoa_SRP.30-201ENST00000621054 280 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007347.2-201ENST00000623044 180 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 DMD-212ENST00000378723 4645 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC24A4-205ENST00000532405 9950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEPSECS-202ENST00000382103 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPP6R3-218ENST00000529710 3228 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 DEPDC5-205ENST00000400248 5307 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC149-204ENST00000504487 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 KLHL2-209ENST00000514860 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP2B2-203ENST00000383800 8900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRRC27-204ENST00000368614 6374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 GALNTL6-203ENST00000506823 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL353795.3-201ENST00000624351 5702 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 DHX35-203ENST00000373325 3287 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBM19-203ENST00000545145 4422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPIN3-218ENST00000639007 4277 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRPS1-209ENST00000519674 3116 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP9A-201ENST00000311637 7437 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 LAMC2-201ENST00000264144 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 ELP3-201ENST00000256398 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZFY-204ENST00000449237 3464 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBM27-201ENST00000265271 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 TIMP2-203ENST00000585421 3345 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 SORL1-204ENST00000525532 3836 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 NTN4-202ENST00000344911 3152 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms