Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR5

KRTAP4-2, Keratin-associated protein 4-2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-2Q9BYR5 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 FN1-207ENST00000421182 8103 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF700-201ENST00000254321 2882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 ELP3-219ENST00000537665 3053 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 CTNND1-215ENST00000526938 3489 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 WDR33-202ENST00000393006 3574 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 MED29-207ENST00000615911 3565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 AL133325.3-201ENST00000622757 3674 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 NLRP3-206ENST00000391828 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC7A5-203ENST00000565644 3983 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 CENPO-201ENST00000260662 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 NPHS1-202ENST00000378910 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 NLRP1-215ENST00000613500 4494 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 USP28-201ENST00000003302 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 ARHGEF11-201ENST00000361409 5788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 COL14A1-202ENST00000297848 6466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 MEGF10-203ENST00000503335 7571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 SNX29-205ENST00000566228 8171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 NCAM1-229ENST00000621518 4922 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 IP6K1-209ENST00000613416 4806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 ITPR1-219ENST00000544951 4131 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 IKBKB-202ENST00000416505 4036 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF430-201ENST00000261560 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 DCLRE1B-201ENST00000369563 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC35A4-202ENST00000514199 3617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 NELL1-201ENST00000298925 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 NAT10-210ENST00000615292 3329 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 GPATCH2-201ENST00000366934 3218 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 AC055713.1-201ENST00000498967 8279 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 TTC12-201ENST00000314756 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 HECTD3-201ENST00000372168 2530 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 PKP1-202ENST00000352845 2244 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 KBTBD11-OT1-204ENST00000635855 6169 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 COBLL1-203ENST00000392717 9523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 ATAD2B-201ENST00000238789 8103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 CAMTA2-208ENST00000572543 4496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 CSMD2-204ENST00000373380 4379 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 DDA1-201ENST00000359866 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 CICP22-201ENST00000432801 1319 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 DOK6-201ENST00000382713 8890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 ESYT1-201ENST00000267113 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 HK1-201ENST00000298649 3596 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 KCNB2-201ENST00000523207 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC39A13-204ENST00000524928 3553 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 CBLB-203ENST00000403724 3350 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 OGDHL-203ENST00000432695 3383 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 RAD17-205ENST00000354868 3060 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 GON4L-202ENST00000361040 5118 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 EIF3CL-202ENST00000398944 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 SALL2-207ENST00000614342 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 NIN-201ENST00000245441 10293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 C14orf159-229ENST00000523816 2764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 NBN-203ENST00000409330 4523 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 PIK3C2B-204ENST00000424712 7522 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 DCTN1-204ENST00000409438 4145 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 DPP4-201ENST00000360534 3904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 CFAP69-201ENST00000389297 3902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 NLRP12-201ENST00000324134 3801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 TDRD1-203ENST00000369282 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF175-201ENST00000262259 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 CD99L2-203ENST00000370377 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 CLDN19-203ENST00000539749 3517 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC38A2-201ENST00000256689 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 OR4D9-203ENST00000641962 6123 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 FCHO1-216ENST00000596536 3204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 ZBED4-201ENST00000216268 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 ESRG-201ENST00000583516 3140 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 DSG3-201ENST00000257189 5525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 DDX3X-203ENST00000457138 5346 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 RBM27-201ENST00000265271 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 RAPGEF3-202ENST00000395358 4092 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 PCDHAC1-202ENST00000409700 4077 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 XKRX-201ENST00000372956 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 MIR9-3HG-203ENST00000546186 2718 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 SAR1A-205ENST00000373242 5981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 MAP4K4-203ENST00000347699 3792 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 ADD1-206ENST00000398129 3787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 KRBA1-207ENST00000496259 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 HRH4-201ENST00000256906 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 LCMT1-AS2-201ENST00000562280 2601 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 LILRA2-201ENST00000251376 4429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 OXCT1-201ENST00000196371 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms