Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 NCAM1-221ENST00000615112 5967 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 OR2T10-202ENST00000642090 3519 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 PLCD4-206ENST00000450993 3232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RPL28-201ENST00000344063 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 GABRA1-202ENST00000393943 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AGAP1-212ENST00000614409 9932 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF442-201ENST00000242804 6219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ARID1B-232ENST00000637904 5913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 TAF8-210ENST00000494547 2402 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ELN-205ENST00000358929 3967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 TRO-202ENST00000319167 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MYO18A-202ENST00000527372 9992 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 NAIP-204ENST00000503719 5347 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 LIMCH1-218ENST00000513024 5129 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CADM3-AS1-201ENST00000415675 5044 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 PTGS2-201ENST00000367468 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 PHC1P1-201ENST00000554937 3061 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 GPT2-202ENST00000440783 4228 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 TEX13D-201ENST00000632372 4203 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 POU6F1-201ENST00000333640 2960 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CARD14-201ENST00000344227 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 UPF2-202ENST00000357604 5193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MSN-201ENST00000360270 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ST6GAL1-215ENST00000457772 3947 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 EPHB1-211ENST00000493838 2786 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 FOXJ2-202ENST00000428177 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 RPGR-203ENST00000378505 4767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CD99L2-203ENST00000370377 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM47A-201ENST00000346193 2556 ntAPPRIS P2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CLTC-215ENST00000621829 8587 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC12A4-203ENST00000537830 3525 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 NCOA4-204ENST00000581486 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MID1-201ENST00000317552 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 EXD2-202ENST00000409014 3404 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AC022784.6-204ENST00000520390 3442 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 FGF11-202ENST00000572907 2358 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MTERF2-207ENST00000552029 3235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 LAMB4-202ENST00000388781 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 TACC2-202ENST00000334433 9377 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MRS2-204ENST00000443868 3980 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 COLQ-203ENST00000383788 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ADGRF2-204ENST00000507065 3043 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 GLYR1-201ENST00000321919 3772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AP1B1-203ENST00000402502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MYOM1-202ENST00000356443 5847 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 GLI1-208ENST00000546141 3475 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ERP44-201ENST00000262455 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 OR1D2-203ENST00000641833 4887 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CENPC-201ENST00000273853 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ITGAD-201ENST00000389202 3912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CELF2-215ENST00000636488 3908 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CUX1-201ENST00000292535 13747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SYNPO-204ENST00000519664 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC02418-202ENST00000567788 4592 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 AP4S1-211ENST00000616371 4595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MFN1-205ENST00000471841 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ARL3-201ENST00000260746 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 PLCG2-201ENST00000359376 3819 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 NOTCH2-201ENST00000256646 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SETBP1-201ENST00000282030 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 FOXP4-201ENST00000307972 3745 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 BACH2-201ENST00000257749 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MRAS-210ENST00000614350 4377 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MAPT-AS1-204ENST00000634876 3602 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 EP400-205ENST00000389562 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 CACNB4-239ENST00000636947 5575 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 MAGED1-202ENST00000375695 2875 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 NCAM1-222ENST00000615285 6045 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 SEMA4G-201ENST00000210633 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-9Q9BYP9 EPN3-201ENST00000268933 4071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.2 ms