Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.29-201ENST00000616220 280 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 SH3BP5-AS1-202ENST00000420195 5570 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 MAP4K4-212ENST00000456652 3855 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 CKAP2-201ENST00000258607 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 TMOD2-203ENST00000539962 3000 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 GOSR2-232ENST00000640051 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 CLIC5-201ENST00000185206 6023 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 MIR137HG-205ENST00000634594 3586 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 OR2G6-203ENST00000641804 6084 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 IL17RD-202ENST00000320057 4474 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 CCT5-201ENST00000280326 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 DPY19L3-205ENST00000586987 5925 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 FAR2P1-201ENST00000325390 3679 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 LMO3-208ENST00000441439 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AC012501.1-201ENST00000454312 555 ntTSL 4 BASIC7.82□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 RN7SL849P-201ENST00000485236 295 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 IGKV1-27-201ENST00000498435 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC7.82□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 RN7SL178P-201ENST00000582930 304 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 UBE4B-202ENST00000343090 5267 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 DHX35-201ENST00000252011 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 ABCA4-201ENST00000370225 7309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 NNT-208ENST00000512996 4288 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 PTPRE-202ENST00000306042 4957 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 MEF2A-201ENST00000338042 5464 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 TOGARAM2-201ENST00000379558 12691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 GON4L-217ENST00000615926 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 ZNF569-202ENST00000392149 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 SLC37A3-202ENST00000340308 2955 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 FLJ42393-201ENST00000623801 2270 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 SLC7A2-203ENST00000470360 7638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 KIDINS220-202ENST00000319688 3765 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 FAM111A-202ENST00000420244 3780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 HHLA2-201ENST00000357759 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 ERCC4-201ENST00000311895 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 CCDC129-205ENST00000451887 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 RFT1-201ENST00000296292 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AC104083.1-201ENST00000569449 2615 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 RNA5SP396-201ENST00000364834 120 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AC004830.1-201ENST00000420449 285 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AC233724.1-201ENST00000503894 233 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 EGFLAM-211ENST00000514476 676 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 MIR4518-201ENST00000580665 83 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 NPIPB5-207ENST00000451409 3660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 TRIO-201ENST00000344135 4065 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 CASC15-203ENST00000605917 4461 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 PSMD5-AS1-213ENST00000640327 3531 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 LINC02111-201ENST00000505158 2312 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 CLUAP1-212ENST00000576634 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 XAF1-202ENST00000361842 3623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 NLGN4Y-203ENST00000382868 5338 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 SORBS1-209ENST00000371245 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 ERMAP-201ENST00000328249 3949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.3 ms