RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365430.1

RNU6-487P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 487, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-487P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-487P-201ENST00000365430 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
RNU6-487P-201ENST00000365430 CHIC1Q5VXU3 224 aa11.41□□□□□ -0.58
RNU6-487P-201ENST00000365430 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
RNU6-487P-201ENST00000365430 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
RNU6-487P-201ENST00000365430 FOXD1Q16676 465 aa9.75□□□□□ -0.85
RNU6-487P-201ENST00000365430 POTEDQ86YR6 584 aa9.57□□□□□ -0.88
RNU6-487P-201ENST00000365430 MSH5O43196 834 aa9.3□□□□□ -0.92
RNU6-487P-201ENST00000365430 PLPPR3Q6T4P5 718 aa9.11□□□□□ -0.95
RNU6-487P-201ENST00000365430 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
RNU6-487P-201ENST00000365430 PPP6R1Q9UPN7 881 aa8.85□□□□□ -0.99
RNU6-487P-201ENST00000365430 ADRA2BP18089 450 aa8.81□□□□□ -1
RNU6-487P-201ENST00000365430 KCNA4P22459 653 aa8.34□□□□□ -1.07
RNU6-487P-201ENST00000365430 DMRT2Q9Y5R5 561 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-487P-201ENST00000365430 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
RNU6-487P-201ENST00000365430 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
RNU6-487P-201ENST00000365430 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa8.13□□□□□ -1.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 EHMT2Q96KQ7 1210 aa8.13□□□□□ -1.11
RNU6-487P-201ENST00000365430 NPM3O75607 178 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
RNU6-487P-201ENST00000365430 DCAF8L1A6NGE4 600 aa7.9□□□□□ -1.14
RNU6-487P-201ENST00000365430 RNF39Q9H2S5 420 aa7.88□□□□□ -1.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 CSRNP3Q8WYN3 585 aa7.84□□□□□ -1.15
RNU6-487P-201ENST00000365430 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
RNU6-487P-201ENST00000365430 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
RNU6-487P-201ENST00000365430 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa7.78□□□□□ -1.16
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZBTB22O15209 634 aa7.73□□□□□ -1.17
RNU6-487P-201ENST00000365430 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
RNU6-487P-201ENST00000365430 DNAJC5BQ9UF47 199 aa7.66□□□□□ -1.18
RNU6-487P-201ENST00000365430 FOXD4L1Q9NU39 408 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-487P-201ENST00000365430 POTEHQ6S545 545 aa7.45□□□□□ -1.22
RNU6-487P-201ENST00000365430 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP7.45□□□□□ -1.22
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC4A2P04920 1241 aa7.44□□□□□ -1.22
RNU6-487P-201ENST00000365430 DSG3P32926 999 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 CAPN15O75808 1086 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RNU6-487P-201ENST00000365430 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RNU6-487P-201ENST00000365430 ATXN8OSP0DMR3 200 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-487P-201ENST00000365430 FKBP8Q14318 412 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-487P-201ENST00000365430 APLP2Q06481 763 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRHP20396 242 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RNU6-487P-201ENST00000365430 ABCB7O75027 752 aa7.01□□□□□ -1.29
RNU6-487P-201ENST00000365430 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RNU6-487P-201ENST00000365430 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RNU6-487P-201ENST00000365430 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RNU6-487P-201ENST00000365430 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RNU6-487P-201ENST00000365430 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RNU6-487P-201ENST00000365430 CHRDL2Q6WN34 429 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-487P-201ENST00000365430 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RNU6-487P-201ENST00000365430 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RNU6-487P-201ENST00000365430 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RNU6-487P-201ENST00000365430 POLA2Q14181 598 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-487P-201ENST00000365430 AKT1S1Q96B36 256 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPDYE4A6NLX3 237 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 PIP4P2Q8N4L2 257 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-487P-201ENST00000365430 HAX1O00165 279 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC24A1O60721 1099 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-487P-201ENST00000365430 FBLN2P98095 1184 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-487P-201ENST00000365430 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-487P-201ENST00000365430 PROM2Q8N271 834 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-487P-201ENST00000365430 VASPP50552 380 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-487P-201ENST00000365430 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-487P-201ENST00000365430 PITPNM1O00562 1244 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-487P-201ENST00000365430 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-487P-201ENST00000365430 OSCARQ8IYS5 282 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-487P-201ENST00000365430 FBXO3Q9UK99 471 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-487P-201ENST00000365430 EVX2Q03828 476 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RNU6-487P-201ENST00000365430 PKD2Q13563 968 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-487P-201ENST00000365430 DCAF8L2P0C7V8 631 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-487P-201ENST00000365430 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
RNU6-487P-201ENST00000365430 SSUH2Q9Y2M2 353 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPDYE2BA6NHP3 402 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPDYE6P0CI01 402 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPDYE2Q495Y8 402 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RNU6-487P-201ENST00000365430 LHX8Q68G74 356 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-487P-201ENST00000365430 KLHL34Q8N239 644 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-487P-201ENST00000365430 C19orf67A6NJJ6 358 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-487P-201ENST00000365430 GABBR2O75899 941 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RNU6-487P-201ENST00000365430 PLCD3Q8N3E9 789 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPOCK2Q92563 424 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-487P-201ENST00000365430 CLEC11AQ9Y240 323 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-487P-201ENST00000365430 PLCB2Q00722 1185 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-487P-201ENST00000365430 MIER1Q8N108 512 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-487P-201ENST00000365430 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.39
RNU6-487P-201ENST00000365430 RGL2O15211 777 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-487P-201ENST00000365430 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RNU6-487P-201ENST00000365430 STAG3Q9UJ98 1225 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-487P-201ENST00000365430 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RNU6-487P-201ENST00000365430 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RNU6-487P-201ENST00000365430 PLSCR2Q9NRY7 297 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-487P-201ENST00000365430 CLCN6P51797 869 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-487P-201ENST00000365430 CHADLQ6NUI6 762 aa6.25□□□□□ -1.41
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