Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MAP3K4Q9Y6R4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms