Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF6Q9Y4K3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms