Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KDM2AQ9Y2K7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM2AQ9Y2K7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms