Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PUF60Q9UHX1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PUF60Q9UHX1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms