Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKX1-2Q9UD57 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms