Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXTL2Q9UBQ6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL2Q9UBQ6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms