Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3EQ9NVU0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3EQ9NVU0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms