Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCAF13Q9NV06 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCAF13Q9NV06 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCAF13Q9NV06 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCAF13Q9NV06 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCAF13Q9NV06 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCAF13Q9NV06 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCAF13Q9NV06 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCAF13Q9NV06 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCAF13Q9NV06 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCAF13Q9NV06 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCAF13Q9NV06 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCAF13Q9NV06 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCAF13Q9NV06 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms