Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPRMQ9NS64 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms